故事发生在结城友奈是勇者剧情三百年前。西元2018年,日本四国丸龟市,Vertex首次侵略人类世界。和亲友上里日向一起修学旅行中的主角乃木若叶目睹了Vertex残杀同学的惨剧，在反抗中接触到供奉在神社中的古刀而觉醒了勇者的力量，从此率领伙伴们对抗Vertex,成为四国的最后希望。本作为勇者系列的最开端，叙述第一代勇者的艰辛、勇者系统的来历，并解释勇者系列世界观的缘由。

2017年8月某日。平城学馆中等部三年・朝比奈北斗和镰府女学院中等部一年级・伊南栖羽降落在那霸机场。 刀剑类管理局为了参加与美军共同开发的“S装备[风暴装甲]”的运用试验，作为试验安装者参加。 当天。另一位刀使抵达了冲绳。绫小路武艺学舍初等部六年燕结芽。她们互相不知道，是没有关系的人。现在还没有。 这个故事记录了她们不为人知的斗争。围绕S装备的计谋中，北斗、栖羽、结芽，还有亲卫队和舞草的剑尖交叉。TV动画《刀使巫女》本篇一年前的故事！

描绘了至今为止没有被提及的第一代勇者和巫女们的身影！ 结城友奈这一代300年前的初代勇者一代。 在残酷的命运中生存下来的第一代勇者和支撑着它的巫女们的故事。

TV动画《结城友奈是勇者》第一季和第二季之间发生的另一个故事。 神世纪300年，秋天。结城友奈等人的赞州中学勇者部被选为勇者之后，来自四国各地的32位勇者后补因未被选中而被大赦集结在黄金塔中，并给予了他们新的「防人」角色。 曾经与三好夏凛争夺勇者宝座而败北的原勇者候补生楠芽吹，赌上自己骄傲的战斗轨迹。